農藥殘留測定儀是采用酶抑制原理和光電比色法原理研制而成。在一定條件下，有機磷和氨基甲酸類農藥對膽堿酯酶正常功能有抑制作用，其抑制率與農藥的濃度呈正相關。酶抑制原理可簡單理解為：將果蔬有效部分提取到液體，利用膽堿酯酶的催化反應，并將其分解物轉變為顏色，設定一組不含農藥的標準液，正常情況下其顏色會比較深，將其作為參照，如果被測樣品含有農藥，其反應就會被抑制，導致顏色很淺，通過抑制率的計算即可判定陰陽性結果。